【摘 要】
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[目的]运用现代分子生物学及高通量测序技术,研究不同品种玉米雄穗花器官分化期响应干旱胁迫的差异miRNA和其靶基因,挖掘和鉴定与玉米发育相关的基因,分析其性状差异的信号通
【机 构】
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新疆农业科学院粮食作物研究所,乌鲁木齐 830091
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[目的]运用现代分子生物学及高通量测序技术,研究不同品种玉米雄穗花器官分化期响应干旱胁迫的差异miRNA和其靶基因,挖掘和鉴定与玉米发育相关的基因,分析其性状差异的信号通路及分子调控网络.[方法]以耐旱自交系“PHBA6”和干旱敏感自交系“吉63”为研究对象,应用深度测序技术进行miRNA文库构建,鉴定其差异表达的miRNA,对差异表达mi RNA及其靶基因进行功能注释、聚类分析及通路富集.[结果]鉴定了总共337种前体miRNA,其中包含289种已知的miRNA和48种新的miRNA.在3个文库,两个分组中共有155种差异表达miRNA.基于GO功能分类及遗传和基因组(KEGG)的功能富集显示,这些miRNA可能通过靶向一系列与胁迫相关的基因而在干旱胁迫中发挥作用.至少55个预测的靶基因进一步被60个miRNA调控.NAC,MYB和MAPK基因家族在干旱胁迫下评分最高,在植物抗旱中重要作用.一系列miRNA与这些排名靠前的基因相关,包括miR164、miR172、miR1520、miR6158、ghr-n24、ghr-n56等.[结论]miRNAs可能在玉米雄穗花器官分化期耐旱中发挥重要作用,miRNAs的筛选为分子辅助育种和转基因育种将提供新的靶标.
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