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越来越多的证据表明，表观遗传学与瘢痕疙瘩形成机制可能相关。与正常皮肤相比，瘢痕疙瘩全基因组胞嘧啶-磷酸二酯键鸟苷岛中低甲基化比高甲基化更常见，且相关基因的启动子区亦存在同样现象。启动子的高甲基化通常发生在易感基因的相同位点，甲基化可能起到早期标记物的作用。去乙酰化酶的表达明显增高，活性增强，基因的组蛋白乙酰化修饰水平降低，细胞凋亡下降，最终促进了瘢痕疙瘩的发生发展。miR-21等23种miRNA表达上调，miR-203等9种miRNA表达下调。表观遗传学路径在瘢痕疙瘩的形成和发展中的作用值得进一步研究。