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新近在环境基因组学研究上的突破和常温型泉古菌纯培养株系的获得揭示出氨氧化古菌（AOA）是一个不同寻常的功能类群．通过对氨氧化过程的关键酶之一氨单加氧酶（AMO）α亚基的编码基因（amoA）的系统发育分析发现，AOA是一个独立于氨氧化细菌（AOB）进化枝之外的进化类群．目前巳确认，AOA是自然界中最丰富的氨氧化生物，其amoA基因的拷贝数最高可超过AOBamoA基因拷贝数3个数量级．在自然生态系统，尤其是海洋生态系统中具有十分重要的生态地位．据热力学估算，海洋AOA每年生成的NO2与全球海洋新生产力（即海洋