甜瓜α-甘露糖苷酶基因家族的全基因组分析

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α-甘露糖苷酶(α-mannosidases,α-Man)是生物界广泛存在的一种糖苷水解酶.通过已公布的甜瓜基因组数据库预测α-Man基因家族成员,其蛋白序列都含有完整的Glyco_hydro_47或Glyco_hydro_38保守结构域.再将筛选出的成员与拟南芥、大豆、番茄、可可树、葡萄、黄瓜、马铃薯、谷子的相应基因编码的蛋白序列进行进化分析比对,建立系统发生树和保守基序的预测分析.结果表明,甜瓜基因组中含有8个α-man基因,分为Ⅰ类和Ⅱ类,并分成5个亚族.同一类成员的蛋白结构域具有较高相似性与保守性
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