基于生物信息学方法探讨非酒精性脂肪性肝炎免疫浸润特征及风险模型构建

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wbmissing
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非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic Steatohepatitis, NASH)已成为严重影响患者生活质量和预期寿命的肝脏疾病,且发病机制复杂。为探讨免疫浸润在非酒精性脂肪性肝炎发病机制中的作用,从高通量基因表达数据库中下载肝脏单纯脂肪变性、非酒精性脂肪性肝炎和健康受试者的数据集。使用R limma软件包对差异表达基因进行筛选。通过功能注释和富集分析探讨其生物学功能。用无监督的聚类及单样本基因集富集分析观察聚类模式所对应的免疫浸润类型。结果共获得1 569个差异基因,以及与NASH进展相关或不相关的两种修饰模式A、B。B模式相较A模式对应较高的肝纤维化程度,小叶炎症及气球样变程度以及非酒精性脂肪性肝病活动性评分。免疫浸润分析显示具有免疫应答或促炎功能的细胞以及免疫抑制作用的细胞均在B聚类模式中富集。基因集变异分析显示B模式富集了细胞黏附分子等免疫相关通路及神经鞘脂质代谢等代谢相关通路。最后确定了5个因子用于风险模型的构建,预测模型训练集和验证集的受试者工作特征曲线下面积分别达到0.982和0.987。以上发现有助于更深入了解NASH的发病机制,且为临床预测非酒精性脂肪性肝炎的发病风险提供参考。
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