基于 LibSVM 的 CKSAAP 蛋白特征提取预测水稻蛋白质磷酸化位点

来源 :湖北科技学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Raistlin_M
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本文从swiss-prot中选取经过试验验证的水稻蛋白质磷酸化位点数据作为训练集合,应用蛋白质序列特征提取方法Composition of k-spaced residues pairs (CKSAAP),为利用SVM算法构建专门针对水稻蛋白质磷酸化位点的预测工具做准备。 CKSAAP方法利用在序列片断中残基的K个间隔距离的组成,进一步反映了残基之间的相关性。本文利用LibSVM软件包对已通过改进过得CKSAAP方法特征提取出来的数值特征对磷酸化位点进行预测,从而为之后构建水稻蛋白质磷酸化位点的预测工具做
其他文献
九华山佛教音乐是中国佛教音乐的重要组成部分,近年来其生存现状堪忧,对其历史、现状及未来的发展方向进行合理、科学的评估,并提出相关建议是当今佛教音乐研究者最为重要的
目的:减少药流后阴道流血量.方法:将200例药流病人随机分为观察组和对照组各100例,观察组口服米非司酮及米索后,待孕囊排除予口服加味生化汤,用药7天,14天回院随访;对照组孕
目的:建立利胆排石颗粒中大黄素及大黄酚的含量测定方法.方法:高效液相色谱法,Hypersil-C18柱.结果:该方法有效消除了干扰,所选定的色谱条件可同时测定大黄素及大黄酚的含量,
郁病,历代医家多有论述.张机所著<金匮要略>即记载了百合病、妇人脏躁证及被后世称为"梅核气"的"咽中如有炙脔证",初步确立了郁病的雏型.至元代<丹溪心法>又丰富了该病的内容
案4咳嗽(慢性支气管炎)安某,女,54岁.1966年因受风寒,咳嗽迁延12年.每年入秋则发,冬季加剧,甚则不能平卧.
体育教学改革对如何培养学生的体育兴趣、爱好和习惯非常的重视,对于女生来说,激发和培养她们的学习兴趣就更为重要了。
数学课堂就是数学+活动,要把课堂变为学生学习活动的场所,组织数学活动,激活学生思维。让学生自主地参与数学教学活动,灵活运用数学知识,积极创新,使其个性、潜能得以充分开
对较严重的跟骨骨折单纯采用保守方法治疗效果一直不甚理想,后期常有疼痛、扁平足、跟骨畸形等后遗症而严重影响患肢功能.近年来,随着对跟骨生物力学、病理机制的深入研究,CT
笔者在医疗实践中体会到,糖尿病的病机主要是阴虚燥热,气虚血瘀.从血液流变学以及临床观察指甲、口唇的变化,证实瘀血是形成糖尿病及糖尿病合并症的重要因素.在糖尿病的整个
于某,男,31岁,家住北京市大兴区大庄村,2000年冬因经常在户外盘坐打牌致右足逐渐下垂,不能抬起,走路呈"公鸡步态".患者在某医院拍腰椎CT片示:L3-4间盘膨出压迫硬膜囊(轻度),L