大熊猫轮状病毒CH-1株外衣壳蛋白(VP7)基因的克隆和生物信息学分析

来源 :畜牧兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lzl1988

【摘要】

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为研究大熊猫轮状病毒（Giant Panda Rotavirus,GPRV）CH-1株外衣壳蛋白VP7基因的结构及功能,用MA-104细胞（恒河猴胎猴肾细胞）增殖GPRV,提取总RNA,运用RT-PCR扩增VP7基因,并测序,用

【作者】

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颜其贵雷燕张志和王成东阳爱国王旭左兰

【机构】

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四川农业大学动物生物技术中心,成都大熊猫繁育研究基地,四川省动物疾病预防控制中心,四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川农业大学生命科学与理学院

【出处】

：

畜牧兽医学报

【发表日期】

：

2010年6期

【关键词】

：

大熊猫轮状病毒 VP7基因克隆生物信息学分析

【基金项目】

：

教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT0848);成都大熊猫繁育研究基金会科研项目(CPF08013)

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为研究大熊猫轮状病毒（Giant Panda Rotavirus,GPRV）CH-1株外衣壳蛋白VP7基因的结构及功能,用MA-104细胞（恒河猴胎猴肾细胞）增殖GPRV,提取总RNA,运用RT-PCR扩增VP7基因,并测序,用生物信息学软件预测其功能,并构建系统进化树。结果显示成功获得了长1042bp的GPRV VP7蛋白基因（GenBank登录号GU188284）。经生物信息学分析,此序列包含1个981bp的完整开放阅读框,编码326个氨基酸;预测GPRV VP7蛋白理论相对分子质量为37354.8u

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