【摘 要】
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转录组SSR引物的开发为接骨木遗传多样性分析、遗传图谱构建和功能基因的挖掘提供丰富的遗传标记。以一株成年西洋接骨木的果实为实验材料,提取RNA后,采用Illumina HiSeq 200
【机 构】
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山东省林业科学研究院,山东省林木遗传改良重点实验室,山东农业大学
【基金项目】
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山东省农业重大关键技术“耐盐碱林木及经济作物品种选育及示范推广”(2015ZDJS03003);山东省农业良种工程“高抗逆药用接骨木新品种选育与示范”(2016LZGC017);山东省林业科技创新项目“接骨木、元宝枫种质资源创新与高值化利用”(LYCX05-2018-24)
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转录组SSR引物的开发为接骨木遗传多样性分析、遗传图谱构建和功能基因的挖掘提供丰富的遗传标记。以一株成年西洋接骨木的果实为实验材料,提取RNA后,采用Illumina HiSeq 2000高通量测序获得西洋接骨木转录组数据,共得到西洋接骨木转录组的257975条Unigene,检测到64148个SSR位点,分布于51336条Unigene,SSR位点出现频率为24.87%(SSR位点数与总的Unigene数的比值),其中,单核苷酸重复是主要类型,占总SSR的51.13%。其次是二、三核苷酸重复,分别占总S
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