水稻SBP基因家族的生物信息学分析

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SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN–LIKE (SBP) 转录因子家族是植物特有的一类转录因子.本文确定了20水稻基因组上编码的SBP基因.通过分类,染色体定位,保守区确定,亲缘关系,以及水稻SBP家族中的重复基因及该家族成员形成蛋白二聚体的可能性进行分析,其次利用了Affymetrix水稻基因组芯片数据,对所有这些基因的表达谱进行了分析.结果表明,水稻SBP基因在花和种子的发育过程中可能发挥重要作用,而其对环境胁迫却不敏感.这对进一步研究SBP的功能提供了有价值的线索和思路.
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