基于混合选择的GEP算法及其在喹诺酮羧酸类HIV-1整合酶抑制剂活性的QSAR研究中的应用

来源 :计算机与应用化学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kernel_gdi_user
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提出1种混合使用模拟退火和竞赛规则选择算子的改进GEP算法-GEPMS算法。以E-Dragon软件计算、经RM算法筛选得到的7个RDF描述符作为自变量,以抗HIV-1活性IC_(50)值作为因变量,基于GEPMS算法建立关于48种喹诺酮羧酸类化合物的HIV-1整合酶抑制剂活性的QSAR模型。与GEP、GEPSA和v-SVM算法建立的QSAR模型进行比较,本文模型、GEP、GEPSA和v-SVM模型对训练集的计算结果,决定系数R~2分别为0.9667、0.9624、0.9348和0.9711,对验证集的预测结果R~2则分别为0.9565、0.8974、0.9124和0.7656,表明本文的GEPMS模型具有最佳的泛化能力,算法的改进效果明显。
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