【摘 要】
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基于隐马可夫模型,利用已知丝氨酸羧肽酶(Serine Carboxypeptidases,SCP)氨基酸序列作为训练集,搜索拟南芥全蛋白质组数据库,鉴定了54个推定的SCPL(丝氨酸羧肽酶类,Serine Ca
【基金项目】
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中国科学院资助项目，浙江省科研项目
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基于隐马可夫模型,利用已知丝氨酸羧肽酶(Serine Carboxypeptidases,SCP)氨基酸序列作为训练集,搜索拟南芥全蛋白质组数据库,鉴定了54个推定的SCPL(丝氨酸羧肽酶类,Serine Carboxypeptidase-Like)基因,详细分析了各基因的结构特征、染色体定位与编码的蛋白质序列,发现7个可能最近发生复制事件的基因簇聚区,并且其SCPL基因广泛存在交替剪接方式.系统进化分析表明,88.9%基因编码的蛋白质属于双链羧肽酶l或Ⅱ亚族,仅11.1%蛋白质属于单链羧肽酶Ⅲ亚族,暗示
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