抗真菌耐药性给临床治疗侵袭性真菌感染造成极大的困难,现有抗真菌药物由于存在药物-药物间的相互作用以及严重的毒副作用而受到极大的限制。非白色念珠菌属对氟康唑耐药问题受到人们的广泛关注,光滑念珠菌对唑类的耐药率逐年上升,烟曲霉对唑类耐药性主要是由于唑类药物在临床上或环境中的广泛暴露导致烟曲霉对其敏感性降低,这些耐药性病原微生物都是导致侵袭性真菌感染的主要病原菌。另外,曲霉属及其它霉菌对临床上大部分抗真菌药物表现出降低的敏感性和广泛的耐受性。近年来由于广谱抗生素及免疫抑制剂的过度使用,深部真菌感染的发生率呈现逐年上升趋势,而现有抗真菌药物对全身性真菌病或血液感染型真菌病的治疗效果却无法令人满意,病人一旦患上全身性真菌病,其病死率较高。如何有效治疗深部真菌感染已成为临床迫切需要解决的问题。目前,大量新药处于临床前期研究阶段,这些新型化合物的靶标除了已知的麦角甾醇和β-葡聚糖合成酶,还有一些新的作用机制能够克服现有药物的耐药性和毒性。本文综述了现有真菌药物的耐药性以及正在研发过程中的新型抗真菌药物。