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ISSR标记是一种基于微卫星序列发展起来的十分有效的分子标记。本文主要利用ISSR分子标记对我国39份茶树种质资源进行遗传关系研究，从40条引物中筛选出15条引物，共扩增出143个位点，其中多态性位点为131个，占91．6％。通过UPGMA聚类分析，39个茶树种质资源GS变化范围0．21～0．95，其中慢奇兰与竹叶奇兰GS值最大、遗传相似程度最高，遗传距离最近；崇庆枇杷茶与英红1号GS值最小、遗传相似程度最低、遗传学差异最大。聚类分析将39个种质资源划分为3个大类（GS=0．20），崇庆枇杷与英红1号，属