稻瘟菌WD重复功能域中SSR的变异及其对蛋白结构的影响

来源 :植物分类与资源学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cjbin1688
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含WD重复功能域的蛋白能够参与信号传导、转录调控、RNA剪切、细胞的凋亡等多种功能,在病原菌与寄主植物蛋白互作的过程中扮演着重要的角色。本研究分析了稻瘟病菌基因组中94个WD功能域基因编码区和调控区中SSR的组成、分布,并检测了7个蛋白编码区中SSR的变异及其对蛋白二级结构的影响。结果表明,WD功能域基因的编码区和调控区中都含有大量的SSR,但是SSR在这些基因的外显子区、内含子区、5’一UTR和3’一UTR区中SSR的组成和分布均不相同;编码区中三碱基和六碱基SSR分布较多,这些SSR基序大都表现为GC
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