【摘 要】
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目的 了解2011年上海地区手足口病重症和轻症患儿中肠道病毒71型(EV71)分离株VP1、VP4区的基因特征.方法 对来自2011年重症与轻症手足口病患儿的各5株EV71分离株进行VP1、VP4全序列的RT-PCR扩增测序,并与美国国立生物技术信息中心公布的EV71 A、B、C基因型代表株进行核苷酸、氨基酸比对分析和系统进化分析.结果 轻、重症患儿的EV71分离株之间VP1基因的核苷酸同源性为9
【机 构】
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200032上海,复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫生安全教育部重点实验室,上海市闵行区疾病预防控制中心,上海市闵行区疾病预防控制中心,200032上海,复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫
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目的 了解2011年上海地区手足口病重症和轻症患儿中肠道病毒71型(EV71)分离株VP1、VP4区的基因特征.方法 对来自2011年重症与轻症手足口病患儿的各5株EV71分离株进行VP1、VP4全序列的RT-PCR扩增测序,并与美国国立生物技术信息中心公布的EV71 A、B、C基因型代表株进行核苷酸、氨基酸比对分析和系统进化分析.结果 轻、重症患儿的EV71分离株之间VP1基因的核苷酸同源性为96.0％～98.1％;VP4基因的核苷酸同源性为93.7％～99.5％.轻、重症患儿的EV71分离株与C基因型代表株比较接近,VP1区核苷酸同源性分别为86.9％～98.2％、87.4％o～98.5％,VP4区核苷酸同源性分别为85.5％～100.0％、84.5％～99.5％,其中与2008年安徽省阜阳市的EV71流行株(C4亚型)VP1区核苷酸同源性分别可达97.0％～98.2％、97.9％～98.5％,VP4区核苷酸同源性分别可达96.1％～100.0％、97.1％～99.5％.3例重症患儿分离株在VP1和VP4的天冬酰胺(N)282丝氨酸(S)、苏氨酸(T)7丙氨酸(A)同时发生变异.结论 2011年上海地区10例轻、重症手足口病患儿中分离的EV71流行株均属C基因型的C4亚型；3例重症患儿分离株在VP1和VP4的N282S、T7A同时发生变异。
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