【摘 要】
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[背景]淡玫红鹅膏(Amanita pallidorosea)是鹅膏属檐托鹅膏组的一种剧毒鹅膏菌,其子实体内含有丰富的鹅膏环肽毒素,但其编码毒环肽和相关肽的基因家族“MSDIN”尚待深入研究.[目的]探究淡玫红鹅膏中编码毒环肽及相关肽的基因家族成员的多样性、保守性及其系统发育.[方法]采用Illumina HiSeq 2000平台对淡玫红鹅膏转录组进行测序,使用TBLASTn软件对MSDIN基因家族进行检索,并设计特异性引物进行PCR验证,通过生物信息学比对分析MSDIN基因家族成员的种类和序列构成,通过
【机 构】
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湖南农业大学生物科学技术学院 湖南长沙410128;广东省科学院微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室 广东广州510070;广东省科学院微生物研究所华南应用微生物国家
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[背景]淡玫红鹅膏(Amanita pallidorosea)是鹅膏属檐托鹅膏组的一种剧毒鹅膏菌,其子实体内含有丰富的鹅膏环肽毒素,但其编码毒环肽和相关肽的基因家族“MSDIN”尚待深入研究.[目的]探究淡玫红鹅膏中编码毒环肽及相关肽的基因家族成员的多样性、保守性及其系统发育.[方法]采用Illumina HiSeq 2000平台对淡玫红鹅膏转录组进行测序,使用TBLASTn软件对MSDIN基因家族进行检索,并设计特异性引物进行PCR验证,通过生物信息学比对分析MSDIN基因家族成员的种类和序列构成,通过重建分子系统发育树了解其演化历程.[结果]通过对MSDIN基因家族的查找,从转录组数据获得了60条环肽编码基因,经PCR验证其可编码32条环肽,包括α-鹅膏毒肽、β-鹅膏毒肽和羧基二羟鬼笔毒肽.本研究报道了8条新环肽.分子系统发育树分析显示,鹅膏环肽分为鹅膏毒肽、鬼笔毒肽和未知功能环肽3大支.系统发育结合保守序列推测出7条潜在的新毒肽.[结论]淡玫红鹅膏具有丰富的鹅膏环肽资源,利用转录组测序能够系统挖掘鹅膏环肽新资源,为其整体结构解析奠定基础.
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针对于陈官庄古近系沙河街组地层发育的较大断层,进行断裂识别的方法研究.首先根据研究区域的地质资料和测井解释资料,选取能够较好地识别断层的地震属性(如方位角倾角属性、相干属性、构形张量属性和曲率属性);然后沿断层分布位置获取各个优选属性的层位切片,进行单属性分析、解释工作.但单属性分析存在一定的多解性与局限性,为实现地质构造分析、储层预测的目的,最后选择利用主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)方法对各个地震属性进行融合处理,得到的综合属性对目标层位的断裂发育情况进行
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总有机碳含量(TOC)是评价页岩生烃能力的关键性指标,岩心样品测试仅能获得离散的TOC含量,且成本较高.基于页岩在常规测井上的响应特征,运用多元回归分析法、拓展ΔlgR法、RBF神经网络法对威远地区筇竹寺组页岩TOC含量进行预测.结果表明:①优质页岩测井曲线响应特征通常表现为“四高两低一扩”,即高自然伽马、高电阻率、高声波时差、高中子、低密度、低光电吸收截面指数、井径扩径,同时测井曲线响应特征还受矿物成分的影响;②ΔlgR法运用于较深页岩储层的TOC预测时,需根据研究区具体地质情况进行合理的改进;③相比多
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