蛋壳和环境细菌对生长鸡肠道菌群的影响

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不同来源获得的肠道微生物群对动物的健康和生产力有着深远的影响。在现代家禽生产实践中,建立微生物的来源及其在胃肠道群落发育过程中的总体贡献仍不清楚。利用来自2个独立来源的受精卵,我们评估了蛋壳和环境相关的微生物群落在孵化后6周内对鸡整个肠道的演替过程和细菌群落结构的影响。培养和测序技术在蛋壳上鉴定出一个活的、高度多样化的厌氧菌群。对卵类、环境型和传统饲养的鸟类来说,空肠、回肠和盲肠的微生物群落通常表现出相似的演替模式,其特征是随着时间的推移,群落的丰富度和均匀度不断增加,在这2个试验中,3个输入组都有大量肠球菌、罗布次氏菌(Romboutsia)和未分类的毛螺旋菌。细菌群落结构因试验和微生物群输入而存在显著差异,但暴露于卵细胞和常规鸟类在第1周空肠和第6周回肠中除外。盲肠群落结构因试验和微生物输入源而异,第6周盲肠短链脂肪酸谱也显示出功能差异。我们在暴露于与蛋壳或环境有关的微生物群的鸟类与传统孵化的鸟类之间,发现了不同的肠道微生物群落和不同的盲肠短链脂肪酸谱。我们的数据表明蛋壳在鸡肠道微生物群的发育中起着重要的作用,尤其是在空肠和回肠中,纯蛋鸡的群落结构与传统孵化的鸟类相似。我们的数据确定了蛋壳和环境微生物群在鸡肠道内的建立和演替过程中的复杂相互作用。进一步的研究应该探索蛋壳和环境中的微生物形成演替动态的能力,以及如何通过干预措施来确定这些群落的目标,从而促进肠道健康并减少家禽中的食源性病原体定殖。
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