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在一个成人长达10米的肠管内寄居着大量的各种共生菌，按现代的先进方法监测，估计至少有500种不同细菌，总数为10乃～10”，是一个成人身体全部细胞数的10～20倍，而他们的全部基因数为人基因数的100倍或更多。通过检测显示，从成人肠黏膜组织和粪便中查出的395种细菌中，244种（62％）为新发现的细菌，且80％都是从未培养出来的细菌，其中大多数属于硬壁菌门（Firmicutes）和类杆菌门（Bacteroides）。