分枝杆菌Rv2450c T细胞表位预测及分析

来源 :武汉轻工大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zhaojuan2582

【摘要】

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对Rv2450 c进行T细胞表位预测分析.在NCBI上获取Rv2450 c蛋白质序列,运用ExPASY(ProtParam)对Rv2450c蛋白进行理化性质分析,Expasyde的Protscale程序对Rv2450c蛋白进行疏水性

【作者】

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王培东何俊才周放张露郑辉刘(亭) 余晓丽

【机构】

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武汉轻工大学生物与制药工程学院,湖北武汉,430023;武汉市金银潭医院,湖北武汉,430000

【出处】

：

武汉轻工大学学报

【发表日期】

：

2019年1期

【关键词】

：

Rv2450c 生物信息学抗原表位

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对Rv2450 c进行T细胞表位预测分析.在NCBI上获取Rv2450 c蛋白质序列,运用ExPASY(ProtParam)对Rv2450c蛋白进行理化性质分析,Expasyde的Protscale程序对Rv2450c蛋白进行疏水性分析,NetMHC在线基本软件预测并分析Rv2450c的CD4+T细胞表位的分布情况;Bimas、NetMHC、和NetCTL软件预测并分析Rv2450 c的CD8+T细胞表位的分布情况.经筛选得出CD4+T细胞的优势表位5个,CD8+T细胞优势表位2个;综合CD+T细胞表位与CD8+T细胞表位分析结果,最终筛选出T细胞表位预测为:SQGIRAWP159—166.预测出的T细胞候选表位可为结核病疫苗开发提供参考.

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