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建立中药“对照指纹图谱”为标准中指纹图谱相似性比较及相似度限值的确定提供参考。以SPSS统计分析软件对人参、黄芩的HPLC色谱数据所代表的指纹图谱相似度及影响相似度的因素进行研究。中药指纹图谱相似度的影响因素由样品所含的主要化学成分所引起 ,相关系数法比夹角余弦法对指纹图谱中小色谱峰变化的反应明显。提出了在中药质量标准中使用“对照指纹图谱”作为中药指纹图谱相似度比较的参照系。