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基本粒子群算法（Particle Swarm Optimization,PSO）用于生物网络布局优化存在以下不足：存在影响布局优化的边界效应（boundary effects）,并且仅适用于小规模网络.针对边界效应提出了无边界限制的PSO算法（FPSO算法）.该算法一定程度上减少了边界效应对布局的影响.针对较大规模生物网络布局,提出了具有免疫反向学习特性的PSO算法（IO_FPSO算法）.采用主观评价、目标函数评价和布局准则定量评价进行算法比较,实验结果表明FPSO算法明显优于基本PSO算法,而IO_FP