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聚类分析是数据挖掘技术中的一种重要的分类方法,有着广泛的实际应用.现实的分类问题往往伴有模糊性,对具有相似关系的元素进行分类,需要将相似矩阵改造为等价矩阵.而要将相似矩阵改造为等价矩阵,只需要求相似矩阵的传递闭包.文章将模糊聚类分析传递闭包方法应用于生物种群遗传分化的研究,进行了实例分析,给出了模糊聚类分析传递闭包方法的实现过程和聚类分析结果.