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为评价匹里青河水生生态，2017年春季对匹里青河水生生态开展调查，调查以水生生物为主。调查结果显示，匹里青河现有浮游植物31种，浮游动物2种，底栖动物12种，水生植物3种，鱼类5种。匹里青河出山口以下河道形态及水域环境由于受到人类经济活动的影响已发生了一定程度的变化，这将对该河栖息的鱼类构成直接影响。饵料生物浮游植物种类较多，硅藻为优势种；浮游动物种类较少；底栖动物12种，上游为固着卵石种类，中下游为广布种。水生植物种类较少。鱼类组成较为简单，仅5种，均为土著鱼类。