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目的：了解新疆贫困县卫生服务利用现状，为促进新疆贫困县卫生服务的合理利用提供客观依据。方法调查采用随机抽样方法，从新疆36贫困县中随机抽取6个贫困县的46个乡镇卫生院进行调查和数据收集。定量资料采用SPSS 17．0软件进行数据分析，定性资料采用内容归纳法整理。结果2007-2011年新疆六贫困县乡镇卫生院总诊疗人次，门急诊占总诊比重，入院占总诊比重的平均增长率分别为－2．12％，－0．76％和15．15％，仅入院占总诊比重的平均增长率高于全疆全国平均水平。2011年总诊疗人次和门诊人次主要来源于乡镇卫生院；入院人次和急诊人次主要来源于县医院。2011年新疆六贫困县乡镇卫生院的床位使用率和床位周转次数分别为：87．18％和43．78次，均高于全疆和全国平均水平。结论县医院在农村三级卫生服务体系中的龙头作用正逐步凸现，乡镇卫生院的中心枢纽地位也正处于不断巩固上升之中，而村卫生室在农村三级卫生服务体系中的基础地位仍有待提高。