西南桦叶绿体基因组密码子偏好性分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hot_way
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
密码子偏好性广泛存在于各种植物中.本研究利用Codon W和在线软件CUSP分析西南桦(Betula alnoides)叶绿体基因组中的45条蛋白编码序列.结果 显示,西南桦叶绿体基因组的ENC值在36.86~56.10之间,密码子第3位上的GC含量为27.80%,RSCU>1的密码子中有23个以A或U作为结尾,说明其密码子偏好以AU结尾;ENC与密码子第3位碱基的GC含量呈显著相关;3种图形分析均表明西南桦叶绿体基因组密码子偏好性受突变影响较大;最优密码子以C结尾的有7个,G结尾的有2个,U结尾的有1个.本研究为西南桦无性系地理种源鉴定、保持种源多样性提供了科学依据.
其他文献
为了初步明确仿刺参中Akt基因的序列信息、进化特点以及生物功能,本研究利用分子生物学手段获得了仿刺参Akt基因(AjAkt)的cDNA全长,并,对该基因的序列特征、组织表达规律以及
本研究基于苦荞转录组,筛选克隆一条与黄酮合成相关的MYB转录因子基因,命名为FtMYB56.生物信息学分析表明,该基因cDNA全长825 bp,编码蛋白含有274个氨基酸,包括R2和R3保守结
在小鼠胚胎发育过程中,有报道显示FGF信号通路在着床前胚胎的细胞分化中起关键作用.然而,人着床前胚胎的细胞分化分子机制尚未明确.本研究利用体外发育第7天和第3天的人着床
[目的/意义]学术论文贡献句是体现论文创新性和学术价值的重要形式。以学术论文全文本和MeSH主题词为数据基础,利用自然语言处理和深度学习技术,实现学术论文贡献句识别,为学术文本创新贡献内容的细粒度挖掘奠定基础,对实现基于认知计算的学术论文评价具有重要的理论和现实意义。[方法/过程]首先,以PubMed论文全文本为数据来源,抽取论文Mesh主题词,对论文贡献句进行要素分析和特征提取。其次,采用半自动方式实现标注数据。最后,基于Albert深度学习模型实现贡献句的自动识别。[结果/结论]通过数据一致性检验证明
相关论著、书目大多认为,《对山书屋墨馀录》主要有清同治九年(1870)湖州醉六堂吴氏刻本、清同治十三年(1874)毛氏甲戌定本两种刻本.然而,醉六堂本并非原刻本(最早版本),仅系
[目的 /意义]我国图情领域目前正处于学科功能转变的阶段,研究范式差异明显,引起广泛的讨论.研究旨在发现学科哲学范式与数据范式各自存在的逻辑断层,丰富、完善学科理论体系
[目的/意义]将个人学术信息组织行为看作整体来测量其行为能力和行为结果,开发出大学生学术信息组织水平量表,并应用该量表简要分析北京大学本科生的个人学术信息组织行为的特征,以提供具有实际价值的改进建议。[方法/过程]在开发量表时,首先在文献调研、半结构化访谈的基础上编制初始量表,然后运用项目分析、因子分析进行量表纯化,最后通过信效度检验评估量表的质量。在应用量表时,使用了描述性统计、相关分析、差异分析等方法。[结果/结论]大学生学术信息组织水平量表包括电脑文件组织水平、纸质资料组织水平、学术信息管理素养、学
MicroRNA(或miRNA)是位于基因组非编码区的内源性大小为21~25个核苷酸的小分子单链RNA,在植物新陈代谢、器官发育、生殖生长以及响应各种生物和非生物逆境胁迫中起重要调节作
为了考察二甲双胍对链脲佐菌素诱导的糖尿病肾病大鼠的治疗作用.将60只雄性SD大鼠随机分为对照组、模型组和二甲双胍组,对照组大鼠应用标准饲料饲养,模型组和二甲双胍组大鼠
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是世界第六大恶性肿瘤,术后复发和转移仍然是制约肝癌患者生存的一个重大难题.美国的癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)计