Tandem repeat查找方法比较

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Tandem repeat在基因组成和进化中起到非常重要的作用,查找和分析Tandem repeat已经成为当前生物信息学的一个前沿领域和研究焦点.目前在这一研究领域存在多类解决方法,主要有基于LZ分解技术的方法和最近兴起的基于后缀树索引的方法.本文选取了两种时间复杂度达到O(nlogn)数量级的代表性的方法,对这两种方法进行了全面的综述,并对它们的性能进行了系统的比较和分析.
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