转录组测序分析FOXD3基因对胃癌细胞调控的分子机制

来源 :胃肠病学和肝病学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:high
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目的探讨FOXD3在胃癌细胞中可能调控的基因,阐明其在胃癌发生、发展过程中的可能机制。方法 通过慢病毒感染技术建立FOXD3基因过表达MKN45细胞系及对照组MKN45细胞系,利用转录组测序技术检测两组细胞的基因表达谱,通过生物信息学方法比较两组细胞间的差异表达基因(DEGs),分析DEGs的基因本体论(GO)功能富集及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集情况,并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。结果FOXD3基因过表达后,筛选出586个DEGs,其中343个DEGs表达上调,243个DE
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