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民营企业与国有资本合作能够降低民营企业的融资成本,更易于争取到由政府主导分配的资源,如补贴和税收优惠等。但是如果政府希望通过合作实现政策目标,将有可能扭曲民营企业的经营目标,降低民营企业的经营绩效,抑制民营企业的创新活动。国有资本能够显著提升民营企业的创新水平,体现为合作程度越高,民营企业创新投入和创新产出增加越多,创新效率提升越显著;在行政壁垒高的地区,民营企业创新水平提升更明显;在产权保护力度越差的地区,民营企业的创新产出和创新效率改善越显著,但是创新投入并无显著增加。