拷贝数变异全基因组关联分析及数量性状基因座定位联合鉴定猪体高性状候选基因

来源 :畜牧兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wangluochg

【摘要】

：

旨在利用全基因组拷贝数变异区域(copy number variation regions,CNVRs)关联分析以及全基因组数量性状基因座(quantitative trait locus,QTLs)定位联合筛选出影响猪体高性状

【作者】

：

欧阳峰正王立刚岳静伟颜华张龙超侯欣华刘欣王立贤

【机构】

：

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

【出处】

：

畜牧兽医学报

【发表日期】

：

2020年7期

【关键词】

：

大白×民猪F2代猪群体拷贝数变异数量性状基因座体高全基因组关联分析 Large White×Min pig F2 populatio

【基金项目】

：

国家生猪产业技术体系(CARS-35),国家自然科学基金(31872337)

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旨在利用全基因组拷贝数变异区域(copy number variation regions,CNVRs)关联分析以及全基因组数量性状基因座(quantitative trait locus,QTLs)定位联合筛选出影响猪体高性状的候选基因。本研究利用快速检测基因组拷贝数变异软件CNVcaller对本实验室构建的大白×民猪F2代资源群体的重测序数据进行拷贝数变异检测。利用混合线性模型(mixed-linear model,MLM)将性别和胎次作为固定效应对体高性状进行拷贝数变异全基因组关联分析(C

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