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南宁杯环线虫新种形态上同鼻状杯环线虫比较相似,如口囊中部具有隔板样物和具有20个外叶冠小叶.但新种具有较多的长丝状内叶冠小叶,数目在160～200个之间,而鼻状杯环线虫只有约60个很短的圆形内叶冠小叶.另外,新种线虫头端侧乳突并不特别向外突出;整个头端、口领和口囊形状也不如鼻状杯环线虫那样明显地背腹压扁.