自2000年起从广西各地采集1563份犬脑、4份发病牛脑、1份发病猪脑和1份猫脑组织,通过对这些动物脑组织进行PCR检测及用小白鼠脑内接种试验分离出42株狂犬病毒株,并对N基因3’端455个核苷酸片段进行测序分析。根据核苷酸同源性及遗传进化树分析结果,广西狂犬病流行毒株可分成4个群,Ⅰ群有GX01、GX08、GX09、GX014、GX019、GX091、GX123、GX173、GX174、GX195、GX260、GX443、GX 452、GX510、GX520、GX BS、GXSL、GXGG、GXLA、GXHX、GXGL、GXNn iu、GXWXp共23株,它们的核苷酸同源性在97.6%~100%之间;Ⅱ群有GX074、GX219、GX304、GX441、GX442、GX496、GX0510、GXBX、GXBM、GXQZ共10株,它们的核苷酸同源性在98.5%~100%之间;Ⅲ群只有GXN119;Ⅳ群有GX506、GX508、GX509、GX120、GXB03、GX cat、GX201、GX102共8株,它们的核苷酸同源性在99.1%~99.6%之间。进一步氨基酸变异分析得知,与兽用疫苗株ERA比较,所有42个毒株的第58位氨基酸由P变为S,I、Ⅱ、Ⅲ群的34株共同发生了H26Y、C40S、S61N、V95L、G106D和P135S位点的变异,I群发生了T90N和E110D、Ⅱ群发生了T42S的群特异性变异。氨基酸分析结果与核苷酸同源性、遗传进化树分析结果一致。各群毒株呈现明显的地域分布特征,Ⅰ群主要分布在桂东地区,Ⅱ群主要分布在桂西地区,Ⅳ群主要分布在桂南地区。