【摘 要】
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旨在研究鸡脂肪组织中TC F21基因启动子区DNA甲基化水平与其表达的关系.以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系(简称高、低脂系)第24世代7周龄肉鸡为试验材料,利用RT-qPCR检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因的mRNA表达水平;利用生物信息学和双荧光素酶报告系统分析TCF21基因启动子的结构与功能;利用Sequenom MassARRAY飞行质谱检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因启动子区CpG位点的甲基化水平;利用CpG甲基转移酶处理TCF21启动子报告基因质粒,分析DNA甲
【机 构】
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农业农村部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨150030;黑龙江普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030;东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030
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旨在研究鸡脂肪组织中TC F21基因启动子区DNA甲基化水平与其表达的关系.以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系(简称高、低脂系)第24世代7周龄肉鸡为试验材料,利用RT-qPCR检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因的mRNA表达水平;利用生物信息学和双荧光素酶报告系统分析TCF21基因启动子的结构与功能;利用Sequenom MassARRAY飞行质谱检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因启动子区CpG位点的甲基化水平;利用CpG甲基转移酶处理TCF21启动子报告基因质粒,分析DNA甲基化对TCF21基因启动子活性的影响.结果 显示,高脂系肉鸡腹部脂肪组织中TC F21基因的mRNA表达水平极显著高于低脂系(P＜0.001);TCF21基因的启动子区存在40个CpG位点,且在启动子的近端和远端均有分布,但不存在CpG岛;将TCF21基因的启动子划分为5个功能区域,分别为R1区域(-2000～-1500 bp)、R2区域(-1500～-1000 bp)、R3区域(-1000～-500 bp)、R4区域(-500～-200 bp)和Core区域(-200～-100 bp);高脂系R2、R3和R2+ R3区域的DNA甲基化水平显著或极显著高于低脂系(P＜0.05或P＜0.001);R2、R3、R2+R3区域的DNA甲基化水平与TCF21基因mRNA表达水平呈显著正相关(R2区域:r=0.438,P＜0.05;R3区域:r=0.371,P＜0.05;R2+ R3区域:r=0.489,P＜0.05);R2区域的DNA甲基化显著抑制其转录活性(P＜0.05).综上所述,TCF21基因在高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中的表达水平主要与其启动子R2区域的DNA甲基化水平有关.
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