莠去津降解菌泛基因组测序及比较基因组分析

来源 :生物技术通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：huangkb009

【摘要】

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Arthrobacter aurescens TC1和Pseudomonas sp.ADP是目前莠去津降解菌的模式菌株,筛选出Microbacterium sp.HBT4,旨在挖掘这3株不同种属细菌基因组间生物学信息的异同,并预测

【作者】

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王娅丽朱姗姗杨峰山马玉堃付海燕刘春光

【机构】

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黑龙江大学农业微生物技术教育部工程研究中心,黑龙江大学生命科学学院黑龙江省寒地生态修复与资源利用重点实验室,黑龙江大学生命科学学院黑龙江省普通高校微生物重点实验室

【出处】

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生物技术通报

【发表日期】

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2019年7期

【关键词】

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莠去津微杆菌属泛基因组比较基因组分析生物信息学 atrazine Microbacterium sp.HBT4 pan-genome comparati

【基金项目】

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黑龙江省自然科学基金面上项目(C2018051),黑龙江省高校基本科研业务费黑龙江大学专项资金项目(HDRCCX-201614)

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Arthrobacter aurescens TC1和Pseudomonas sp.ADP是目前莠去津降解菌的模式菌株,筛选出Microbacterium sp.HBT4,旨在挖掘这3株不同种属细菌基因组间生物学信息的异同,并预测重要基因。通过Illumina Hiseq 4000测序平台采用DNA小文库制备和测序技术,进行了泛基因组测序,使用相关软件进行基因组组分分析、基因功能注释、基因间变异检测和比较基因组学分析,将分离得到的微杆菌HBT4与模式菌株进行核苷酸组成、共线性及菌株间变异差异分析。得到该菌

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