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中国社会科学院世界经济与政治研究所的李少军先生在所著《国际政治学概论》中认为，在国际关系研究中，存在着运用各种不同方法的情况。从方法论的角度进行总结，这些方法大体上可划分为三个层次。第一个是哲学层次，第二个是学科层次，第三个是具体方法的层次。他指出，除本体论和认识论外，在方法论的哲学层面，人们的研究往往还涉及整体主义（holism）与个体主义（individualism）的分歧。这两者的争论，既涉及本体论问题，也涉及认识论问题。在本体论问题上，两者的分歧在于事物的本原，即事物属性是由它的整体还是由它的组成