【摘 要】
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目的 探讨非小细胞肺癌中,原癌基因Myc调控lncRNA-CCAT1(结肠癌相关转录因子)上游序列的潜在位点。方法 通过GRh37hg19人类基因组数据库确定调控区域,以及ENCODE数据库A549的
【机 构】
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广州医科大学附属第一医院,广州医科大学呼吸疾病研究所
【基金项目】
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广州市科信局2014市健康医疗协作创新重大专项项目(编号:201400000001-2)
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目的 探讨非小细胞肺癌中,原癌基因Myc调控lncRNA-CCAT1(结肠癌相关转录因子)上游序列的潜在位点。方法 通过GRh37hg19人类基因组数据库确定调控区域,以及ENCODE数据库A549的各类ChIP-Seq数据可视化的Wig文件,通过UCSC基因组浏览器,分析Myc的调控普遍结合模式;组蛋白H3K27Ac活化位点和DNase敏感位点,发掘潜在的Myc结合区域,并使用序列匹配的方法,发现与Myc结合的E-box的特征性。结果 基因组分析表明lncRNA-CCAT1与Myc在染色体同一区域,且有
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