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大肠杆菌是犊牛腹泻最常见的细菌性原因，多感染20日龄以内的犊牛，粪便带有血液和炎性产物。沙门氏菌引起2-6周龄的犊牛发生腹泻，也常见于2-3月龄的犊牛发病。魏氏梭菌引起犊牛发生急性出血性肠炎和迅速死亡。轮状病毒和冠状病毒多见于5～15日龄犊牛，也见于6～24月龄的青年牛发病。隐孢子虫是引起3—35日龄犊牛发生腹泻的常见原虫病；球虫感染3周龄以上至1岁龄的牛。