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目的 认识肠沙门菌甲型副伤寒血清型(SPA)的克隆扩散和遗传多样性,建立并确定病原菌流行克隆的分型方法.方法 采用有对照的K-B纸片扩散技术对分离的3980株SPA进行抗微生物药物敏感性试验;经PCR扩增和基因测序检测15个萘啶酸抗性菌株喹诺酮抗性决定区的gyrA、gyrB、syrC和syrE基因;采用Spe Ⅰ和Xba Ⅰ消化染色体DNA脉冲场凝胶电泳(PFGE)对来自7个县的121个分离株进行分型和聚类分析.结果 萘啶酸敏感菌株在1999年占有优势,但2000年以后被萘啶酸抗性菌株替代;15个萘啶酸抗性菌株的PCR扩增和基因测序显示抗性机制是由gyrA基因的单点突变引起;121个菌株spe Ⅰ和Xba Ⅰ消化产物分别得出以Spe Ⅰ 01、spe Ⅰ 02或Xba Ⅰ 01型占优势的5种和4种PFGE型,Spe Ⅰ 01和Spe Ⅰ 02分别占37.2%和57.9%,或Xhn Ⅰ 01占95.0%.结论 在研究期间SPA分离株萘啶酸抗性率上升;PFGE型的SpeⅠ01和SpeⅠ 02或XbaⅠ01是玉溪流行的主要克隆;采用Spe Ⅰ和Xba Ⅰ的PFGE是鉴别SPA的一项有用技术.