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扬子地区古生代盆地基底普遍具有双层结构，下层中深变质基底由太古－下元古界麻粒岩相－角闪岩相、角闪岩相－高绿片岩相变质岩组成，同位素地质年龄为２５～３１亿年、２０～２５亿年，反映了陆核、陆块两个不同的发展阶段；上层浅变质基底由中元古界低绿片岩相变质岩组成，同位素地质年龄为１０～２０亿年，中元古代末的内硅铝造山作用及Ａ型俯冲作用使全区连成不成熟的泛大陆，其西部、北部则发展为低稳定性的克拉通。