Banna病毒TaqMan探针法RT-PCR检测方法的建立

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:juzhaoyang
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读

目的 建立Banna病毒核酸特异的快速、敏感的TaqMan探针RT-PCR检测方法.方法首先对从GenBank中检索到的所有Banna病毒的序列进行同源性分析及引物、探针的设计.病毒在BHK21细胞或C6/36细胞上繁殖扩增后提取病毒RNA和逆转录.以cDNA为模板分别进行TaqMan探针法RT-PCR和传统的PCR检测,并对方法的种内广谱性和特异性、检测灵敏性以及用于蚊虫和临床标本的适用性等进行评价.结果Banna病毒核酸特异的TaqMan探针RT-PCR检测方法具有较好的种内广谱性和特异性,可以检出所有12株Banna病毒,而其他虫媒病毒如辛德毕斯病毒、乙型脑炎病毒、batai病毒和环状病毒检测结果均为阴性.与传统PCR相比,敏感性高100倍以上,可以检出每50μl标本中含有0.5CCID50的Banna病毒.单链RNA变性条件(65℃)进行逆转录使检测结果的敏感性比99VC变性法最少低10倍.病毒在室温保存1天和4℃保存1周后,检出敏感性会比原来低10倍左右.该方法在检测模拟感染Banna病毒的人血清标本以及蚊虫标本时,均显示出较好的特异性.112份蚊标本中检出6份标本阳性,4份可疑阳性,病毒分离结果3份阳性.结论本实验成功建立了Banna病毒特异性核酸的TaqMan探针RT-PCR检测方法,并初步证实可用于血清标本和媒介蚊虫标本的检测,为开展Banna病毒的流行监测及临床早期诊断提供了新的技术手段。

其他文献
期刊
目的 利用抑制性消减杂交(SSH)技术构建重组干扰素β(IFNβ)刺激人肝癌细胞系HepG2差异表达基因的cDNA消减文库,筛选IFNβ下调HepG2相关基因.方法 重组IFNβ 2000 U/ml刺激对数生长期HepG2细胞,以生理盐水作用的HepG2细胞为阴性对照;制备细胞裂解液,从中提取mRNA并逆转录为cDNA,经Rsa Ⅰ酶切后将实验组cDNA分成两份,分别与两种不同的接头连接,再与对照
期刊
目的 对我国首批8个美沙酮维持治疗试点门诊的工作效果进行评估.方法 在美沙酮门诊开诊时、运行6个月及1年后三个时点,对受治者的人口学特征及吸毒有关行为等进行问卷调查,比较吸毒、违法行为、家庭关系等变化情况.结果 共有585人、609人和468人分别参加了基线调查、6个月评估和1年评估调查.受治者过去1个月注射吸毒的比例从基线的69.1%分别下降到6个月后的8.9%和1年后的8.8%;在有注射行为人
目的 研究乙脑病毒持续感染株在不同条件下病毒量的变化及探讨影响病毒增殖的因素.方法 乙脑病毒野生株JaGAr-01株和Nakayama株分别感染人肝癌细胞株KN73,建立乙脑病毒持续感染模型.采用空泡斑点实验进行病毒滴度测定.用持续感染病毒感染人神经纤维母细胞瘤细胞株IMR-32,在30℃和37℃下检测病毒的温度感受性;分别将两种野生株感染持续感染了病毒的KN73细胞,进行病毒重复感染实验;为探讨
期刊
患者女性,38岁.因右上腹疼痛10d伴腹胀、尿黄、纳差2d,2003年11月11日入院.查皮肤巩膜重度黄染.血常规正常,尿胆红素2+,尿胆元±。
期刊
期刊
目的 评价双环醇片治疗成人慢性病毒性乙型肝炎的疗效与安全性.方法 计算机检索中国生物医学文摘数据库,中国期刊全文数据库,和中文科技期刊数据库及PubMed等数据库,纳入比较双环醇片与非特异性治疗、干扰素、拉米夫定治疗慢性乙型病毒性肝炎患者的随机临床试验.纳入试验的质量由两名评价员独立评价.试验数据的统计分析采用Cochrane协作网提供的RevMan4.2软件进行.结果 最终纳入14个临床试验17
目的 研究丙型肝炎病毒血清型对慢性丙型肝炎干扰素抗病毒疗效的影响.方法 对慢性丙型肝炎患者的血清进行ALT检测,采用Cobas amplicor monitor test,version 2.0(v2.0)试剂进行HCV RNA定量和Abbott公司的Murex HCV Serotyping 1-6 Assay试剂进行HCV血清学分型检测.对慢性丙型肝炎患者进行聚乙二醇干扰素α-2a(派罗欣)与罗