目的:通过对TCGA数据库中肝癌和癌旁组织lnc RNA、mi RNA和m RNA进行差异表达分析,研究lnc RNA、mi RNA和m RNA对肝癌发生发展的影响。方法:用得到差异表达的lnc RNA、mi RNA和m RNA构建肝癌ce RNA调控网,明确肝癌中lnc RNA、mi RNA和m RNA之间相互作用的关系及其对肝癌发生发展的影响;为了进一步明确ce RNA调控网对肝癌疾病的作用,对ce RNA调控网中的m RNA进行GO注释分析、KEGG通路分析和蛋白互作分析。结果:发现调控网中的m RNA在肿瘤Mi RNAs、细胞周期、膀胱癌、黑色素瘤、小细胞肺癌、胰腺癌、前列腺癌、结肠癌、P53信号通路、PI3K-Akt信号通路、TGF-β信号通路等18个KEGG信号通路中明显富集(校正后的P<0.01),通过对肝癌ce RNA调控网中的lnc RNA、mi RNA和m RNA进行Kaplan-Meier曲线分析,筛选与肝癌预后有明显相关性的lnc RNA、mi RNA和m RNA。结论:lnc RNA LOC107985899影响mi RNA-137的表达,从而调控m RNA MITF的表达;lnc RNA C2orf48、C10orf91、LINC00114影响mi RNA-204的表达,从而调控m RNA ITPR1、BCL2、AP1S2、TGFBR2、SLC43A1、PRLR、ZCCHC24、ANGPTL2、CHRDL1的表达;lnc RNA LOC107985899影响mi RNA-222的表达,从而调控m RNA ESR1、TIMP3、ZEB2、GALNT3的表达。