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《中共中央、国务院关于进一步加强农村卫生工作的决定》指出：乡镇卫生院以公共卫生服务为主，综合提供预防、保健和基本医疗等服务，受县级卫生行政部门委托承担公共卫生的管理职能。这就明确界定了乡镇卫生院的三大功能，即公共卫生服务、基本医疗服务和公共卫生管理。这种功能定位并不是人为划分的，而是卫生资源合理分布和充分利用的必然选择，是依据区域卫生规划原则的科学界定，是基于我国乡镇人民政府没有设置卫生行政主管机构，也没有配备专职卫生行政人员，乡镇卫生院事实上承担了本行政区域内的卫生行政工作这一基本国情定位的。