甲基化数量性状定位分析microRNA-122 rs1135519多态性与肿瘤遗传易感性

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目的

基于公共数据库中microRNA-122(miR-122)DNA甲基化和基因多态性分型数据,探讨rs1135519 T>C多态性与肿瘤遗传易感性的关系。

方法

利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和泛癌种甲基化数量性状位点(Pan-cancer methylation quantitative trait loci,Pancan-meQTL)数据库,关联分析rs1135519基因型与其上下游1 Mb区域内CpG位点的甲基化修饰水平的相关性。

结果

线性回归分析结果发现,rs1135519 T>C与子宫体子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC)、膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)、结直肠癌(colorectal cancer,CRC)、胃腺癌(stomach adenocarcinoma,STAD)等9种肿瘤患者组织中miR-122基因启动子区cg19165390、cg12907477或cg19312305 CpG位点的甲基化状态显著相关,差异具有统计学意义(P

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