UPF2介导八肋游仆虫NMD途径SURF和EJC的耦联

来源 :山西大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:liubangming98168
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通过生物信息学分析发现八肋游仆虫的UPF2 (EoUPF2)包含三个串联的MIF4G(middle domain of translation initiation factor 4G)结构域和一个C末端UPF1的结合区域.对24种UPF2氨基酸序列的进化关系分析发现,EoUPF2与酿酒酵母的UPF2(ScUPF2)进化关系较为接近.InterPro database数据库分析结果显示,二者的核心结构域非常相似.酵母双杂交和Pull down实验证实:EoUPF2的C末端与EoUPF1的CH结构域相互作用;EoUPF2在没有UPF3存在的情况下,通过其MIF4G结构与外显子连接复合体(exon-exon junction complex,EJC)核心因子Y14a和Y14b相互作用.β-半乳糖苷酶实验证实EoUPF2与Y14a的作用更强一些.qPCR分析结果排除了EoUPF2与Y14a和Y14b相互作用与Y14a和Y14b本身的拷贝数有关.由此我们推断,在八肋游仆虫的NMD识别无义mRNA过程中,EoUPF2通过与Y14相互作用,介导了UPF1与无义mRNA上的外显子连接复合体的耦联,启动了无义mRNA的识别过程.
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