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针对原子力显微镜AFM癌细胞图像,提出一种改进的基于灰度直方图最大熵分割算法。由于原子力显微镜在液相扫描成像过程中受到的干扰因素很多,获得的细胞图像灰度直方图分布不均。首先采取高斯滤波器对细胞图像进行预处理,然后根据图像的灰度直方图进行谷点检测,通过迭代获取最终的谷点序列求取灰度图像的最大熵来选取最佳阈值,最后与数学形态学处理获得最后的分割图像。实验结果表明,该算法能够有效的对原子力显微镜细胞图像进行分割。