排污权初始分配机制构建是排污权交易制度有效实施的关键环节。就中国而言,探索构建以政府为主导的排污权有偿分配体系是更适宜现阶段国情的策略选择。其中,首要问题就是制定合理的初始分配标准,这也是一个颇具争议性的技术难题。本文首先从理论层面分析了社会最优化的排污权配置方案及其对企业生产经营产生的最优激励;进而,通过建立多期排污权交易条件下的企业最优决策模型,细致审视了现行初始分配标准对企业生产经营的跨期激励效应。结果表明,基于污染性资源投入、经济产出、污染排放等企业历史相对绩效的初始分配方案均在不同程度上产生了扭曲性激励,会直接导致无效率的资源配置与次优化的社会产出。作为机制优化设计的途径,提出构建以企业社会责任为内涵的排污权初始分配机制,既可确保制度产生最优激励效果,又能将其它社会外部性问题纳入其管制范畴,促进社会治理的良性互动。最后,结合我国现阶段国情,深入阐释了该新型初始分配机制的必要性与可行性。