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河南和新疆地区HIV-1毒株gp120和gag基因的变异分析

来源 :中国艾滋病性病 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zyf20011027

【摘 要】

：

目的分析中国河南和新疆地区艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)毒株gp120和gag基因全长序列的变异特征。方法PCR扩增河南和新疆HIV-1确认阳性样本前病毒DNA gp120和gag全长基因,测序得到40份gp120和41份gag基因序列,用GCG软件包等软件进行分析。结果河南省HIV-1毒株为B′亚型,新疆维吾尔自治区HIV-1毒株为CRF07 BC亚型。B′亚型毒株gp120基因中变异程度最大的区

【作 者】

：

宋艳辉 邢辉 王哲 张远志 孙峰 何翔 陈建平 邵一鸣 

【机 构】

：

中国科学院武汉病毒研究所,中国科学院研究生院,中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,河南省疾病预防控制中心,新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心

【出 处】

：

中国艾滋病性病

【发表日期】

：

2007年05期

【关键词】

：

艾滋病病毒Ⅰ型 基因距离 选择压力 系统进化树 HIV- 1  Gene distance   Selective pressure   Phylogeneti 

【基金项目】

：

与HIV疫苗研制相关的HLA分型和表位作图研究（N01-A1.30024）,“十五”国家科技攻关项目（2001BA705802和2004BA719A01）（志谢：衷心感谢河南省和新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心对本研究的大力支持.）

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目的分析中国河南和新疆地区艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)毒株gp120和gag基因全长序列的变异特征。方法PCR扩增河南和新疆HIV-1确认阳性样本前病毒DNA gp120和gag全长基因,测序得到40份gp120和41份gag基因序列,用GCG软件包等软件进行分析。结果河南省HIV-1毒株为B′亚型,新疆维吾尔自治区HIV-1毒株为CRF07 BC亚型。B′亚型毒株gp120基因中变异程度最大的区段是V5区段,最小的是C1区段;CRF07BC亚型毒株中变异最大的是V1区段,最小的是C4区段。两种亚型

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