结合主题特征和互作用网络拓扑特性的关键蛋白质识别

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关键蛋白质是生物体内维持生存和繁殖所必须的蛋白质。关键蛋白质的识别和预测不仅对我们理解维持生物生存的最小需求有重要意义,也在药物设计、药物靶标发现等领域有重要作用。已有的关键蛋白质识别算法大多基于蛋白质互作用网络中的拓扑特性,在识别算法中引入了一个新的特征,即考虑到关键蛋白质序列本身的主题分布特征。通过将LDA模型与基于蛋白质互作用网络拓扑特征的CPPK算法相结合,提出了新的识别算法:结合主题模型和蛋白质互作用网络拓扑特性的关键蛋白质识别。该识别算法在酵母蛋白质数据集上测试,并与现有的若干关键蛋白质识别算
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