思南黄牛体重和体尺性状的GWAS分析

来源 :中国畜牧杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ymh19900920
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实验旨在利用全基因组关联分析(GWAS)研究思南黄牛的体重和体尺性状的候选基因及分子标记.选取112头思南黄牛、17头西门塔尔牛以及19头本地杂交牛共计148个个体的外周血样本进行DNA测序.将所有样本检测SNP变异,质控后得到441548个高质量SNP位点.基于SNP位点进行主成分分析、Structure分析和系统发育分析等群体结构分析.主成分分析显示样本牛群具有明显分层,与主成分分析结果相近,系统发育分析结果和主成分分析以及种群结构分析相吻合.基因连锁分析结果发现LD度随距离增加迅速下降.GWAS分别筛选出共计51个与体重和体尺性状相关的SNPs,其中体重23个、体高5个、体长3个、胸宽6个、胸围1个和管围13个,其中24个SNP分别在体重的7个、体高的4个、体长的2个、胸宽的1个和管围的4个共计18个基因内或基因附近,以上结果说明思南黄牛存在与发育、骨骼和肌肉生长性状高度相关的多个基因.这些结果将为思南黄牛品种改良提供重要参考.
其他文献
实验用Logistic、Gompertz和Bertalanffy 3个模型对0~7周龄的wod168、wod178、wod188和爱拔益加AA 4个肉鸡品种的生长曲线进行拟合,旨在探索不同生长速度的肉鸡品种生长发育规律.结果显示:wod168的最佳生长曲线模型是Gompertz模型,模型拟合度(R2)达到0.999,拐点体重、拐点周龄和最大周增重分别为1141.44 g、4.91周和377.01 g.wod178、wod188和AA最佳生长曲线模型均为Logistic模型,对应的模型拟合度(R2)均高于0