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针对蛋白质多重结构比对需要大量运算的问题,基于渐进式成对结构比对策略,设计了并行化的蛋白质多重结构比对架构及其在网格计算环境下的实现机制.实验结果表明并行算法大大提高了比对效率,减少了比对时间,提高了重用性.该并行蛋白质多重结构比对架构及实现方法可应用于其他的多重结构比对.
网格环境下蛋白质多重结构比对的架构及其实现
【摘 要】
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针对蛋白质多重结构比对需要大量运算的问题,基于渐进式成对结构比对策略,设计了并行化的蛋白质多重结构比对架构及其在网格计算环境下的实现机制.实验结果表明并行算法大大
【机 构】
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华南理工大学广东省计算机网络重点实验室,华南理工大学生物科学与工程学院,华南理工大学生物科学与工程学院广东广州510640,广东广州510640
【出 处】
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华中科技大学学报：自然科学版
【发表日期】
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2007年S2期
【基金项目】
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国家科技基础条件平台资助项目(2005DKA64001),国家发改委CNGI资助项目(CNGI-04-15-7A)
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