基于氨基酸对含纤连蛋白域蛋白质亚细胞的定位预测

来源 :中国组织工程研究与临床康复 | 被引量 : 0次 | 上传用户:connine_li
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:含FN域蛋白质在促进细胞迁移、黏附、生长、分化等方面发挥了重要功能,已被广泛应用于各种新型生物材料中.研究它们的亚细胞位置有利于它们的生物功能研究和新型生物材料开发.目的:实现含纤连蛋白域蛋白质的亚细胞定位预测.方法:从UniProt数据库中随机抽取80个人类含纤连蛋白域蛋白质.计算每个蛋白质的400种氨基酸对数量并组成400维向量.分别利用支持向量机和k最近邻法调用每个蛋白质的400维输入向量进行训练和测试.同时,利用jackknife检验法对测试结果进行检验.结果与结论:利用支持向量机法和k最近邻法法预测含纤连蛋白域蛋白质的亚细胞定位预测准确率分别为92.5%和95.0%.说明利用支持向量机和k最近邻法算法预测含纤连蛋白域蛋白质的亚细胞位置具有重要意义,有利于此类蛋白质的功能研究和新型生物材料的表面改造设计.
其他文献
实时数字仿真(RTDS)是目前电力系统分析和研究的重要手段和前沿技术,目前面临的建模难题是大规模电网的模块划分和RTDS系统硬件单元Rack分配问题,合理的模块划分能提高实时仿
目的:观察参松养心胶囊联合胺碘酮预防房颤复发及对心功能的影响。方法:对83例转复窦律的房颤患者,随机分为对照组41例,治疗组42例;对照组单用胺碘酮治疗,治疗组应用参松养心
目的:观察一期前路病灶清除植骨内固定手术治疗下颈椎结核合并后凸畸形的5年以上随访结果。方法:2003年10月~2006年4月,采用一期前路病灶清除自体髂骨植骨钢板内固定手术治疗
应用二向反射光度计实测了部分典型土壤在干燥与一定含水量状态下的偏振反射数据,并以黑土为例测试了其在不同含水量情况下的偏振反射数据,从探测方位角、光线入射天顶角、探
平板探测器锥束CT的扫描方式对ART(Algebraic Reconstruction Techniques)算法图像重建会产生影响。本文用128×128×128三维Shepp-Logan头部模型作为仿真对象,探讨了不同源-扫描中心距离、投影数、缺角度下扫描方式对图像重建的影响。结果表明,源-扫描中心距离与扫描中心-探测器距离成一固定比例时,其重建图像较好;投影数固定情况下,均匀扫描180°重建图
目的 应用RNA干扰技术抑制人舌鳞状细胞癌细胞株Tca8113中双泛素(diubiquitin)的表达,探讨双泛素表达下调对舌鳞状细胞癌细胞生物学行为的影响.方法 构建针对双泛素特异性小
目的 初步探讨内镜下结扎剥离技术治疗胃固有肌层来源小肿瘤的有效性和安全性.方法 对33例患有胃固有肌层来源1 cm以下肿瘤的患者进行内镜下结扎剥离治疗.用皮圈结扎瘤体,之
目的 探讨类风湿关节炎(RA)患者血脂情况以及炎症和免疫状态对血脂的影响.方法 选取2008年至2009年在我院住院的225例RA患者,检测入院第1天的血脂、血沉(ESR)、C反应蛋白(CRP
目的探讨内分水岭梗死(internal border-zone infarction, IBZI)病损模式与动脉粥样硬化和转归的相关性。方法根据磁共振弥散加权成像(diffusion-weighted imaging, DWI )回顾性地将81例IBZI患者分为单纯性IBZI组以及合并其他模式梗死的混合性IBZI组,比较两组的临床特点。然后,进一步将混合性IBZI组分为IBZI+皮质梗死(pial
目的 探讨青壮年股骨颈骨折的治疗方法与疗效.方法 对58例青壮年股骨颈骨折采用闭合复位空心钉内固定治疗,其中男37例,女21例;年龄19~ 56岁,平均37.5岁.Garden分型:Ⅰ型7例,Ⅱ